她曾经在《精灵狩猎者》中为“井上律子”配音。为了能够成功地塑造“明日香”，宫村甚至特地抽时间去学习了德语，专业精神和工作态度可见一斑。由于她在本片中的出色表现，从而成为日本声优界的新星。
　　
　　绫波丽（Ayanami Rei／绫波レイ）
　　有着一双血红色的眼睛和灰色头发的冷艳少女，外貌酷似真嗣的母亲碇唯。在E计划启动阶段就开始接受特殊训练，并以第一适格者（The First
　　Children）的身份担任EVA零号机的驾驶员。她的过去被精心的掩盖起来，以至于让人觉得似乎她根本就没有过去。
　　在最初的故事中，她沉默寡言，表情也相当的贫乏，性格上非常的冷漠。而且，无论交给她多苛刻的任务，都不会有任何异议。在她所住的房间里，除了必需家具之外，没有任何的装饰和电器。在众人的印象中，除了曾经冒险救过她的碇元渡之外，她从未对任何人微笑过。直到在与第四使徒的战斗中被真嗣救下以后，她的性情才发生了微妙的变化。
　　事实上，绫波丽的真实身份是利用碇唯的遗传基因制造出来的人造人，而她的体内封印着第二使徒莉莉斯的灵魂，是“人类补完计划”施行的关键之一。
　　其实，我们这里所说的“绫波丽”其实是三个人物。第一个绫波丽早已经被“三贤人”系统的开发者赤木尚子掐死；在片子前半段中出现的绫波丽是第二个绫波丽，也是逐渐趋于人性化的绫波丽，但她为了保护真嗣而启动了自爆装置，与第十六使徒同归于尽；在TV版尾声和电影版中出现的绫波丽是第三个绫波丽，虽然她有第二个绫波丽的记忆，但却失去了她的人格和感情。
　　给“绫波丽”配音的是林原惠美（林原めぐみ）。她曾经在《DNA2》中为“佐佰伦子”配音，在《三只眼》中为“佩”配音，在《秋叶原电脑组》中为“大鸟居燕”配音，在《秀逗魔道士》中为“莉娜”配音，在《宇宙战舰山本洋子》中为“御堂圆”配音，在《影技》中为“美宁”配音，在《碧奇魂》中为“藤宫红叶”配音，在《乱马1/2》中为“（女）乱马”配音，在《魔神英雄传》为“忍部日美子”配音。除此之外，在本片中，她还负责真嗣的母亲“碇唯”，以及葛城美里家的温泉企鹅“片片”的配音工作。一个人要负责三个角色的确有些辛苦，但应该承认她塑造的每一个角色都很成功。
　　
　　渚薰（NAGISAKAORU／渚カヲル）
　　他是以第五适合者（The Fifth
　　Children）的身份被SEELE直接送进NERV的少年。身材瘦长，有着和真嗣类似的中性性格。令人疑惑的是，他拥有自由控制同频率的特异功能。在淡淡的微笑之下，似乎隐藏着深不可测的内心。
　　虽然出现了的时间不长，但却让真嗣产生了一种难以言喻的亲密感。因此，当真嗣得知他的真面貌是第十七使徒的时候，真嗣感到了前所未有的被出卖感。而且，渚薰与绫波丽接触也使得绫波丽体内的莉莉斯之魂觉醒。
　　他姓名中的“渚”拆开来就是“シ”与“者”，在日语中意为“死者”或者“使者”。
　　为“渚薰”配音的是石田彰。
　　
　　铃原东治（Suzuhara Touji／铃原トウジ）
　　铃原是第三新东京市公立第一中学的学生，真嗣的同班同学，说话带有明显的关西口音。他是那种典型的“运动男孩儿”，性格张扬，但做事时常考虑不周，也不太善于适当地表达自己的感觉。他的妹妹在初号机与第三使徒的作战中，意外受伤。东治曾经将妹妹的受伤归罪于真嗣的错误，并为此打了真嗣。后来，两人最终取得了谅解并成为好友。
　　谁也没有想到，铃原居然以第四适格者（The Fourth
　　Children）的身份，被挑选为EVA三号机驾驶员。然而，当三号机在松代试验场接受启动试验的时候，遭到了第十三使徒的入侵，导致全面失控。后被初号机在自动状态下完全摧毁。铃原虽然侥幸生还，但却身受重伤。
　　为“铃原东治”配音的是关智一。
　　
　　葛城美里（Katsuragi Misato／葛城ミサト）
　　她是亲身经历过“第二次冲击”的少数幸存者之一。在发生爆炸的当时，她的父亲拼命将她救出。由于那次灰色的经历，她曾经一度罹患“失语症”。
　　大学毕业后，怀着为父报仇的目的加入NERV，随后成为作战部长。同时也是三个驾驶员的直属上司，在NERV里是仅次于正、副司令的第三号人物。有着非常出色的战斗组织和策划能力。后因战功卓著而由一尉（上尉）晋升为三佐（少校）。
　　因为真嗣和明日香寄住在她家里，所以她还要作他们的监护人。虽然，她表面上的性格外向、活泼开朗，常常以啤酒加方便面的乐观方式面对生活。可是，当年的心理阴影始终困扰着她，对此她只是曾经在酒醉后向加持良智吐露过。从某种意义上说，葛城和真嗣是同一类人。在剧场版中，葛城为了保护真嗣被流弹击成重伤。在将真嗣最后一次送上EVA之后，她也咽下了最后一口气。
　　为“葛城美里”配音的是三石琴乃。她曾经在《碧奇魂》中为“泽口小梅”配音，在《饿狼传说》中为“不知火舞”配音，在《美少女战士》中为“月野兔”配音。作为一名适应力极强的配音演员，她善于根据不同的脚本设定调整音质音色，塑造出不同性格类型的人物。
　　
　　赤木律子（Akagi Ritsuko／赤木レツコ）
　　“三贤人”系统开发者赤木尚子的女儿，也是E计划的早期参与者之一。在第二新东京大学时，与加持良智和葛城美里相识，并成为好友。后成为NERV技术开发部门首席科学家，是NERV的四号人物。
　　作为一名才智过人的科学家，她的个性属于绝对理智型，处事果断而明快，同时又有着敏锐的直觉。在绝大部分情况下，都身着标准的工作装，有时也给人以不近人情的感觉。在整个故事中，她似乎始终处于边缘地位，以一种超然的姿态审视一切。但是，作为第一流的技术专家，她曾经以高超的计算机技术两度挫败了入侵者试图借助主电脑炸毁NERV总部的图谋。据传说，她和碇元渡有暧昧关系。在剧场版中，她曾试图自行引爆NERV的主电脑，但却以失败而告终，最后死在碇元渡的枪口下。
　　为“赤木律子”配音的是土井美加。她曾经在《超时空要塞MACROSS·可曾记得爱》中为女主角“早濑未莎”配音，是一位善于把握女性特征的配音演员。
　　
　　加持良智（Kaji Ryouji／加持リヨウジ）
　　他是个酷爱冒险，好奇心强，善于处理各类棘手事件的家伙。同时也是葛城美里在学生时代的恋人，而且还一度同居，但后来两人分手。按葛城的说法，在加持的身上能够看到葛城父亲的影子。
　　当他在本片中出场的时候，已经是NERV特殊监察部的高级干部。表面上的任务是从NERV德国支部护送明日香和EVA二号机前往日本，实际上却是负责秘密押运已经封印在卵中的第一使徒亚当前往NERV日本总部。
　　在生活上，他是个不修边幅的浪荡公子，但却很受女性的欢迎。据说，他最大的爱好是在地下都市的空地上栽培西瓜。每每在关键时刻，总能够给真嗣鼓励，帮助真嗣恢复自信心。而对于工作方面的事情，态度极其认真，就连一向待人冷漠的碇司令也对他非常的信任。然而，他的真实身份是日本政府内务省调查部的间谍。最后，由于身份败露而试图撤离。但最后似乎是被葛城美里亲手击毙（片子中没有作正面交待，而是通过大量隐喻加以说明）。
　　负责给“加持良治”配音的是山寺宏一。他曾经在《八犬传》中为“犬山道节”配音，在《乱马1/2》中为“响良牙”，在《天空战记》中为“龙王良马”配音，在《魔神英雄传》为“库拉玛”配音。
　　
　　碇元渡（Ikari Gendou/碇グンドウ）
　　主角碇真嗣的父亲，NERV机关的最高司令长官，是本片中众多谜团的焦点。他原姓六分仪，和碇唯结婚后改姓碇。至于他更改姓氏的原因，片子中始终未作交待。按照日本人的习惯，夫妻结婚以后，妻子应该改随夫姓。而如果是丈夫改随妻姓也就意味着入赘妻家，而入赘对男方要来说是极大的牺牲。
　　他从学生时代开始就是一个相当神秘的人。据说是为了能够更多的了解碇唯身后的秘密组织，才与碇唯交往的。在“第二次冲击”发生之后，他就全力投入与此有关的各种研究。事实上，他和《人类补完计划》以及NERV的成立都有着很深的瓜葛。曾经担任NERV的前身——人工进化研究所的所长。在妻子碇唯意外丧生之后，他更加积极地推动“人类补完计划”的实施。2010年，人工进化研究所改组成为SEELE直属机关NERV，碇元渡随即成为NERV的最高司令长官，并以总负责人的身份参与整个EVA
　　开发计划。此外，他还是SEELE的成员和执行官，负责“人类补完计划”的实施。然而，他真正的目的，是希望通过“补完计划”，与妻子碇唯重会。为了达到这个目的，他不惜付出一切。从这个角度上说，虽然他表面上无视人性与感情、处事极为冷酷，但是骨子里却是个痴情种子。
　　根据贞本义行先生的说法，碇元渡是以《谜の圆盘UFO》中的斯特雷塔司令官的形象为原型设计的。
　　为“碇元渡”配音的是立木文彦。
　　
　　冬月幸增（Fuyutsuki Kouzou／冬月コウゾウ）
　　他原本是京都大学的生物学教授，同时也是碇唯的老师。在“第二次冲击”发生之后，曾经与元渡一起前往南极调查事件的真相。后来，在碇元渡的鼓动下，加入人工进化研究所。后来，和碇元渡一起转入NERV，成为NERV的副司令长官，是基地的二号人物。在碇司令不在的情况下，有代行司令的权力。在所有角色中，他的年龄较大，但洞察力极为敏锐，严峻冷峻，有着非常强的正义感。对于整个计划有着超越常人的了解，但却始终保持沉默。
　　根据贞本义行先生的说法，冬月增幸是以《谜の圆盘UFO》中的副司令官瓦利曼的形象为原型设计的。
　　负责给“冬月增幸”配音的是清川元梦。
　　
　　碇唯（Ikari Yui／碇ユイ）
　　真嗣的母亲，元渡的妻子。也是最早接触核心秘密的科学家。
　　在京都大学读书时，她是冬月教授的得意门生。虽然冬月教授不甚赞成她的婚事，但却依然在“第二次冲击”后与六分仪元渡结婚，并生下碇真嗣。四年后，在EVA原型机的初次启动实验中，因意外事故而溶化在EVA中。
　　日后，在原型机基础上建造而成的初号机体内，埋藏了母亲的灵魂。这也被认为是为什么初号机每每都在关键时刻保护真嗣的原因。
　　负责给“碇唯”配音的是林原惠美。
　　
　　赤木尚子（Akagi Naoko／赤木ナァ〕）
　　她是赤木律子的母亲，计算机科学专家。负责日后成为NERV总部主电脑的超级计算机系统“三贤人”（MAGI）的开发工作。
　　她似乎对碇元渡有着超乎寻常的好感，甚至将私人感情带到了工作当中。在MAGI完成的当日，她从（第一）绫波丽口中得知，碇元渡只是为了利用她的智慧才与她保持关系。恼羞成怒的她，将外貌酷似碇唯的绫波丽掐死，然后便自杀了。
　　“赤木尚子”的配音由土井美加担任。
　　
　　基路·洛仑兹（Keel Lorenz／キ-ルロ- レンツ）
　　SEELE最高评议会的议长，相信是德国人。他是“人类补完计划”的最高决策者和NERV的幕后主宰。他出场的时候，通常用“我们”的复数形式来自称，让人感到他只是组织代言者。在整个片子中，他总用护目镜遮住眼睛，似乎没有人知道他的真实身份，是一个被迷雾掩盖的圣徒式人物。从他的出场情况和对白上看，他似乎和冬月教授以及碇元渡似乎有很深的交情。
　　为“基路·洛仑兹”配音的是麦人。
　　
　　洞木光（Horaki Hikari／桐木ヒカリ）
　　真嗣所在班级的班长，生长在正统家庭，性格比较倔强，相当受班上同学的信赖。同时也是明日香唯一的好友。私底下暗恋着铃原东治。EVA三号机失事后，一直陪伴着受伤的东治。
　　为“桐木光”配音的是岩男润子。
　　
　　相田剑介（Aida Kensuke／相田ヶンスヶ）
　　他是一个典型的都市少年，热衷于武器和摄影，对EVA有很浓厚的兴趣。平日，除了喜欢玩模拟战争游戏之外，也喜欢拿着摄影机去拍摄武器装备。他也是真嗣的同班同学，与铃原东治是一对形影不离的挚交。最大的愿望是能成为EVA的驾驶员，但最终也未能如愿。
　　为“相田剑介”配音的是岩永哲哉。
　　
◆ 剧情梗概
　　故事起始于遥远的“圣经时代”……
　　根据最为古老的犹太《圣经》记述，被称为第一使徒的亚当（Adam）与他的第一个妻子第二使徒莉莉斯（Lilith）结合，从而诞生了“魔界之子”路西法（Lucifer，又译“李林”）。然而，莉莉斯因为不甘臣服于亚当而逃离伊甸园，最终成为了地中海一带作恶多端的“邪恶圣女”。
　　然而，上帝耶和华（YHWH）不能宽恕莉莉斯的背叛行为，于是便派天使（使徒）去捉拿她。但是，莉莉斯与亚当之子，身为第十八使徒和“天使长”的路西法，却违背了神的遗志，试图阻止对莉莉斯的捉拿。因此，路西法成为了“叛神者”，但仍然保持了天使的“美称”，被称为是“堕落天使”。
　　上帝被接二连三的背叛激怒，向路西法发出最后的警告，希望他能迷途知返。然而，路西法为了母亲莉莉斯而放弃了忏悔，拒绝“和解”。于是，盛怒的神褫夺了亚当、莉莉斯以及路西法的天使称号。并派出其余的十五个使徒组成“神军”，讨伐叛逆。
　　在地中海边，路西法孤身于“神军”展开决战。力量单薄的路西法，在经历了三昼夜的血战之后，最终死在众天使的脚下。同为“神的后裔”，这场路西法与众天使之间的“同族”之战，终于以背叛者的失败而告终。
　　而在远方的伊甸园中，亚当和夏娃因为偷吃了“智慧之果”，而触犯了神的禁忌，背负着“原罪”，被赶出了伊甸园。人类从此脱离了神的世界，得以自立。
　　千百万年以后，“诺亚时代”来临。此时的人类变得日益堕落，骄横跋扈、不敬神明。为了惩罚人类，神降下“大洪水”，淹没了整个世界。这就是“第一次冲击”（The
　　First Impact）。然而，人类毕竟是“神的后裔”，虔诚谦恭的诺亚得到了“神喻”，从而用诺亚方舟保全了家人和尘世上的生灵。人类得以在灾难中幸免。
　　在此后的岁月里，人类开始创造自己的文明。在千百年之后，获得了以前被认为只能属于神的“魔术”，人类则称其为“科学”。
　　1999年，当人们为“千禧年”的到来而欢呼雀跃的时候，任教于京都大学的冬月幸增教授与碇唯相识。不久之后，碇唯将自己的男友六分仪元渡介绍给冬月教授。据说，元渡正在借与唯交往的机会，试图接触她背后的神秘组织SEELE。
　　2000年9月13日，神的惩罚终于再次降临了。在南极大陆上，发生了一起不明原因的巨大灾变，而在此之前没有任何征兆。这场巨大的浩劫，造成海平面剧烈上升、地轴扭曲、地磁场不规则扰动。不明来历的灰尘遮盖天空，造成全球性气温下降。经济崩溃、民族纷争、内战……其结果是世界人口急速减少，只剩下原来的一半。南极成为了宁静的死寂地域。这是人类在“诺亚时代”之后，经历的最重大浩劫。史称“第二次冲击”（The
　　Second Impact）。然而，人类终究是智慧生命，重建工作在短暂的混乱之后，逐步展开。
　　2001年，故事的主角碇真嗣诞生。